Voščilo

Vsem svojim bralkam in bralcem želim prijazno božično praznovanje in voščim srečno Novo leto.

Mikrobiologi, 2. letnik

Na spletni strani predmeta najdete rezultate 1. pristopnega kolokvija. 

Mikrobiologi 4. letnik; biotehnologi 3. letnik

Oglejte si sporočilo na blogu Mikrob(io)log; bo koristno za ev. razpravo, ko se bomo na predavanju pogovarjali o GSO.

Mikrobiologi, 1., 2 in 4. letnik; biotehnologi 3. letnik

Predlagam vam, da si na blogu Razgledi.net preberete prispevek dr. Marka Dolinarja "Sintezna biologija: pravi čas za dobre ideje". Dr. Dolinar je eden od mentorjev zmagovalne ekipe študentov UL iz letošnjega tekmovanja  iGEM2007.

Mikrobiologi, 1. letnik

Najbrž ste že dobili sporočilo, sicer si pa lahko ogledate dosežene ocene pri predmetih Uvod v mikrobiologijo in Mikrobiološki praktikum na portalu ŠIS (in tudi na predmetni spletni strani).

Mikrobiologi, 2. letnik

Na predmetni spletni strani najdete razpored skupin in terminski plan za vaje, s katerimi začenjamo v prvem tednu decembra.

Mikrobiologi, 1. letnik

Stanje izpitnih prijav (za 29. 11.) in razpored izpitnih terminov za izpita Uvod v mikrobiologijo in Mikrobioloski praktikum najdete na predmetnem spletu.

Mikrobiologi, 1. letnik

Na predmetnem spletu najdete rezultate in ocene kolokvijev.

Biotehnologi 3. letnik; mikrobiologi 4. letnik

Na predmetnem spletu najdete rezultate tretje vaje Nukleaze pri asist. dr. B. Stresu. 

Od srede, 28. 11., do nadaljnjega sledi ciklus  predavanj (4 teme) o imunobiotehnologiji (prof. dr. M. Narat). Ker na spletu ne bo tekstov teh predavanj, še zlasti priporočam njihov obisk.

Mikrobiologi, 1. letnik

Rezultate (%) 1. in 2. vmesnega preverjanja znanja za Uvod v mikrobiologijo najdete na predmetni spletni stran. Prav tam najdete tudi pravilne odgovore 2. preverjanja znanja ( v pomoč pri pripravi na zaključni izpit). Razdelitev skupin po urah za izpit v četrtek bom objavil na tem blogu v sredo.

Mikrobiologi, 1. letnik

Dobil sem vprašanje vaše kolegice iz letnika, cit.: "Jaz imam vprašanje glede izpita. Za izpit mormo znat tudi to, kar smo delali
pri seminarskah??". Odgovor bo zanimiv za vse in se glasi: "Odgovor je seveda: DA, RAZUMLJIVO. Saj sicer ne vem, čemu bi seminarje sploh delali, če se iz njih tudi ne bi česa naučili." Sicer so pa na predmetnem spletu natančnejša navodila, katero snov je potrebno obdelati za izpit.

Mikrobiologi, 1. letnik

Do danes, nedelje, 9.00,  sem prejel večino seminarjev in prezentacij razen prezentacije za skupino A. Ne pozabite, da imamo v ponedeljek ob 8.00 seminarske predstavitve, nato sledijo še predavanja.

Mikrobiologi, 1. letnik

Na predmetnem spletu najdete navodila za nov niz seminarskih nalog. Danes, 14. 11. 2003 bom ob 15.15 (pred nastopi z asist. Vodovnikovo) razložil tokratne naloge. Na spletu najdete tudi navodila za prijavo k zaključnemu izpitu za oba predmeta.

Mikrobiologi, 1. letnik

Na predmetnem spletu najdete navodila za nov niz seminarskih nalog.

Mikrobiologi, 4. letnik

Na spletni strani predmeta najdete pomembno obvestilo v zvezi s terenskimi vajami.

Mikrobiologi, 1. letnik

Do včerajšnjega roka sem dobil vse eseje in prezentacije razen za skupino E (citoplazma). Ali se lahko med seboj povprašate, kaj se je zgodilo s to skupino oz. s poročevalci (Djaniš in Korošec).

Mikrobiologi, 1. letnik

Prispelo je še nekaj vprašanj na temo "seminarji".  N. Horvat sprašuje o citoplazemskih vključkih: " ... so to hraniva, ki jih shranjujejo nekatere bakterije v obliki zrnc v citoplazmi...".  Odg.: pojem je širši in ne vključuje zgolj rezervnih snovi v celici (primer: zračni mešički). Vpr.: "Ali naslednji izrazi: znotrajplazemski vkljucki, citoplazemska zrna, metahromatska zrna, pomenijo isto kot citoplazmatski vkljucki?" Odg.: ...v glavnem gre za primerljive izraze, predlagam pa da se poenotimo na enem in ustrezen se mi zdi "citoplazemski vključki". Vpr.: " Ali pomeni  izraz v anglescini cytoplasmic inclusion bodies - citoplazmatski vkljucki?" Odg.: ...da, to je angleški sinonimni pojem.

Mikrobiologi, 1. letnik

Odgovarjam na nadaljnja vprašanja v pomoč pri pripravi seminarjev. Študentka A. Cerar sprašuje, cit.:"...sem našla povezavo do slovenskega mikrobiološkega slovarja, zanima pa me, ali obstaja kaj podobnega tudi v angleščini? Torej angleško-angleški mikrobiološki slovar?" Daleč najboljšega mikrobiološkega slovarja Singleton&Sainsbury "Dictionary of Microbiology and Molecular Biology" na spletu ne boste našli, pomagajo pa vam morda lahko tematsko obarvani slovarji na spletni strani All the Virology on the WWW. Priporočil vam bi tudi brskanje po Wikipedii oz. v njenem slovarskem delu Wiktionary ali pa v bolj usmerjenem MicroWiki.

Študentka N. Volmajer želi slišati natančnejšo opredelitev naslova "Preživetvene oblike mikroorganizmov". Najprej: pravilno bi se moral naslov glasiti "Preživitvene oblike mikroorganizmov"; tak naslov seveda vključuje vse možnosti tako imenovanega stanja dormance, ki ima razmnoževalno in preživitveno funkcijo tako pri prokariontih kot pri evkariontih. Kot razjasnitev pojma lahko služi pogled na poglavje "Spore" na strani Wikipedije, sicer pa bo za iskanje koristno uporabiti gesla kot so "spore", "endospore", "exospore", "cyst" "dormancy" ipd.     

Mikrobiologi, 1. letnik

Ker ne vem, ali mailing lista deluje (imel sem težave z njeno uporabo), odgovarjam na nedavna vprašanja v zvezi s seminarji na tem blogu.

Študentka M. Varga sprašuje v zvezi s seminarsko nalogo pri sestavljanju katere sodeluje, kaj pomeni pojem« pathogen-associated molecular patterns (PAMP)«. Pojem slovenimo kot »molekulski vzorci značilni za patogene mikroorganizme« in je v uporabi za manjša molekulska zaporedja, ki jih pogosto najdemo in povezujemo s patogenimi mikroorganizmi. Sprožajo prirojen imunski odgovor s prepoznavo za gostitelja tujih molekul; najznačilnejše bakterijske sestavine s to lastnostjo pa so sestavine celičnih ovojev (lipopolisaharid, lipotejhojska kislina, peptidoglikan) in drugih celičnih sestavin npr. flagelin. Nekaj pojasnil najdete tudi tukaj na Wikipedii.

Študent G. Strugar sprašuje ali na gibanje monotrihih bakterij vpliva tudi Brownovo gibaje (v smislu spremembe smeri), glede na to da imajo samo en biček (oz. dva - po enega na vsakem polu) ali se tudi s tem bičkom orientirajo v prostoru? Zanimata ga tudi pojma »reversible flagella« in »unidirectional flagella«.

Na prvo vprašanje ta trenutek težko izčrpneje odgovorim; zgolj kot predpostavko pa bi rekel, da na bakterijsko celico vpliva tudi Brownovo gibanje, zlasti, ko bički niso v funkciji, da pa aktivnost bičkov najbrž premaga učinke Brownovih sil oz. da kvečjemu pride do interaktivnih pojavov, ko vpliva na gibanje kombinacija različnih učinkov. Nekaj na to temo najdete tudi >tukaj.

Še to: postavitvi dveh bičkov na enem ali obeh koncih celice pravimo, da gre za »lofotriho« postavitev, medtem ko pojem »monotrih« uporabljamo izključno za primer enega samega bička.

Za pojasnitev pojma »reversible flagella« bi za natančnejše pojasnilo potreboval povezavo z dejanskim tekstom v katerem se je pojavila sintagma. V splošnem z besedo reverzibilen opisujemo lastnost, ko neka spreminjajoča lastnost izgine in se lahko znova pojavi, v zvezi z bički bi to lahko bilo povezano s pojavom, da se nekaterim bakterijskim bičkom spremeni sestava (to spremlja tudi antigenska sestava), posledično pa to vpliva tudi na funkcijo (npr. izguba gibljivosti) in ta lastnost se lahko znova povrne.

Pojem »unidirectional flagella« bi tudi lahko bolje pojasnil, če bi poznal tekst v katerem ste ga našli. Najbrž pa je bil povezan s splošno lastnostjo, da bički s spreminjanjem smeri vrtenja spreminjajo tudi obliko gibanja (naprej, nazaj, na mestu, »prekopicujoče« gibanje ipd). Pojem po katerem sprašujete, predvidevam da pomeni biček, ki je sposoben gibanja zgolj v eni smeri.

Mikrobiologi, 1. letnik

Ne pozabite,  jutri smo znova tudi na Rodici... In zanimivo bo!

Biotehnologi 3. letnik; mikrobiologi 4. letnik

Jutri ob 8.00 se dobimo na Rodici, ali ne?

Mikrobiologi, 1. letnik

Jutri, 22. oktobra se zopet srečamo ob 8.oo uri na Rodici, prepričan sem, da zopet v polnem številu. Doslej vas moram pohvaliti za vašo udeležbo. V dopoldanskem delu nadaljujemo o varnem delu v mikrobiološkem laboratoriju, sledi tema o načelih aseptičnega laboratorijskega dela. Nato, kot ste tudi dogovorjeni, nadaljujete program z gdč. asistentko.

Še en bloger mikrobiolog

Slovenskim blogerjem se je pridružil še en študent mikrobiologije z blogom SYMH. Dobrodošel! 

Vsem skupinam

Posebej bi vas rad opozoril na tole novico.

Mikrobiologi, 1. letnik

Dogovorjeno je za nadomeščanje obvez iz zadnjega tedna oktobra; rešitev najdete na predmetni spletni strani.

Biotehnologi 3. letnik; mikrobiologi 4. letnik

Tudi jutri, 17. 10. 2007  vas ob 8.00 pričakujem na predavanju v Viteški dvorani na Rodici. Nadaljujemo s temo iz prejšnjega tedna : Uvod v mikrobno biotehnologijo.

Mikrobiologi, 2. letnik,

Na predavanjih se srečamo v torek, 16. 10. ob 8.00 v predavalnici Ro4. Na spletu najdete pretekla predavanja.

Mikrobiologi, 1. letnik

Znova se sestanemo jutri, 15. 10. ob 8.00;  pričnemo s predavanji na običajnem mestu. Na spletu najdete pretekla predavanja in rezultate prvega kolokvija.

Biotehnologi 3. letnik; mikrobiologi 4. letnik

Jutri, 10. 10. 20076 vas ob 8.00 pričakujem na predavanju v Viteški dvorani na Rodici. Tema: Uvod v mikrobno biotehnologijo. Kogar zanima si lahko ogleda očrt lanskega predavanja: >tukaj  in >tukaj. Časovni trak razvoja biotehnologije najdete >tukaj.

Mikrobiologi 2. letnik

V torek, 9. 10.  ob 8.00 uri va s pročakujem na predavanju. Začel bom z navodili za pripravo seminarskih nalog - esejev in nastopa, nadaljevali pa bomo tudi že s prvo vsebinsko temo. Spremljajte tudi predmetni splet.

Mikrobiologi, 1. letnik

Ne pozabite, >tukaj najdete obvestila in materiale za delo v prihodnjem tednu.

Biotehnologi 3. letnik; mikrobiologi 4. letnik

Na predmetnem spletu sem odložil spiske skupin pri vajah za biotehnologe (BT)  in mikrobiologe (MB) in program za vaje v prihodnjem tednu s pričetkom v ponedeljek in navodila za vaje, ki ste jih MB prejeli od asistenta ločeno tudi na poštno (mailing) listo. Za BT sem sicer dobil individualne elektronske naslove, ker pa ne vem kolikšno priponko lahko sprejme posamezen uporabnik, nismo upali pošiljati materiala tja. Zato si BT tudi poglejte materiale na spletu, na vajah v torek pa boste dobili tudi posamezne izvode materiala.

Društvo študentov mikrobiologije

Danes sem na svoje bloge dodal v nabor priporočenih spletišč naslov Društva študentov mikrobiologije (Slovenije). Po kar nekaj manj uspešnih poskusih v preteklih letih je zdaj zaživelo spletišče, ki pa res obeta veliko, ki bo poleg informacijske funkcije imelo brez dvoma tudi močno povezovalno vlogo. K odločitvi in zasnovi zelo obetavnega in všečnega spleta urednikom čestitam in jim želim, da jih navdušenje in volja ne mineta. POČNETE DOBRO IN KORISTNO DELO!

Biotehnologi 3. letnik

Prosim vas, če mi pošljete na moj e-naslov naslov mailing liste vašega  letnika in pa ime (in e-naslov) predstavnika(ce) letnika.

Mikrobiologi 2. letnik

Na tem spletnem naslovu boste našli učne materiale (predavanja), obvestila o vajah (skupine, urniki) in druge informacije, ki so bodisi oblikovno ali zaradi dolžine neustrezne za objavo na tem blogu. Vsebina torkovih predavanj je že naložena.

Biotehnologi 3. letnik; mikrobiologi 4. letnik

Na tem spletnem naslovu boste našli učne materiale, obvestila o vajah (skupine, urniki) in druge informacije, ki so bodisi oblikovno ali zaradi dolžine neustrezne za objavo na tem blogu.

Mikrobiologi 1. letnik

Na tem spletnem naslovu boste od jutri (petek, 05. 10.) našli (1) imenski spisek skupin za vaje, (2) urnik obvez za prihodnji teden in povezavo do (3) dokumentov s katerimi si boste pripravili papirno verzijo Laboratorijskega praktikuma, ki ga boste potrebovali pri vajah.

Mikrobiologi 2. letnik

Najbolj radovedni ste po današnjem predavanju najbrž že preskusili ali tale blog "deluje" in tudi ali je predmetni splet že zaživel. Naj ta zapis zato izkoristim, da pojasnim, da današnjih predavanj še nisem uspel prenesti na predmetni splet; upam da mi to uspe jutri.

Sprejem brucov

Rektorica Univerze v Ljubljani, prof. dr. Andreja Kocijančič, vabi 1. oktobra popoldan na sprejem novincev na Kongresni trg v Ljubljani. Program dogodka najdete >tukaj.

Za začetek

V TRETJE GRE RADO! To je veljalo meni, saj je to zdaj že tretji blog, ki ga bom oskrboval. Računam pa, da bo tale zelo podprt s pomočjo mojih študentov: s komentarji in če boste želeli, tudi z daljšimi prispevki. Predvsem pa vas bom skušal vzpodbuditi, da se sami lotite bloganja.

Čemu vse to; tudi oba moja druga bloga (LiLoLe in MIKROB(io)LOG - njuna URL najdete v spisku povezav) sta namenjena študentom, vendar ker sta bolj "vsebinska" se mi je zdelo, da moram ustanoviti bolj operativen blog, ki bo predvsem informacijska točka o poteku pouka. V tem semestru namreč začenjamo z bolonjskim programom, kjer bo poudarek na individualnem, kontaktnem delu še večji. Poleg elektronske poštne povezave bo tale blog pomemben vir sprotnih sporočil, morda bomo s časom dodali še delo na wikiju in s portalom Moodle.

Predvsem računam in prosim za aktivno sodelovanje, v skupno korist vseh nas.